科普新闻
世界首个家鸡全基因组图谱绘成
2月16日,记者从西南大学获悉,该校生命科学学院教育部重点实验室徐洛浩教授课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表题为《家鸡基因组完成图的演化分析》的研究论文,以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先完成一个家鸡的全基因组图谱。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中的应用。

人工智能可分析显微镜下细胞运动
分析显微镜拍摄生物过程获得的大量数据一直是研究中的重要工作。最近,瑞典哥德堡大学的研究人员开发出一种人工智能(AI)方法,可以跟踪细胞的运动。这种方法可能对开发更有效的癌症药物非常有帮助。

“黑洞是暗能量来源”首个证据或现身
宇宙中近70%的能量是促使宇宙膨胀的暗能量,但科学家一直不清楚暗能量究竟是“何方神圣”。一个国际科研团队在《天体物理学杂志》和《天体物理学杂志快报》上刊发两篇论文指出,他们对星系中央黑洞开展的观测结果表明,黑洞可能是暗能量的来源,这与爱因斯坦理论预测的结果一致。如果最新研究获证实,困扰科学家20多年的暗能量起源之谜或得到解决,这将彻底改变宇宙学面貌。

光激活抗癌研究取得新进展,比目前最先进的免疫疗法更有效
英国东英吉利大学(UEA)的科学家们离创造新一代光激活癌症疗法又近了一步。这一疗法通过打开嵌在肿瘤附近的“LED灯”来发挥作用,然后激活生物治疗药物。该疗法将具有高度针对性,比目前最先进的癌症免疫疗法更有效。

科普前沿
真正完整、经济实惠、易于使用,新软件按需组装无缝基因组序列
美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰语中意为“网络”,它使组装完整基因组序列的过程更经济实惠且易于使用。研究成果16日发表在《自然·生物技术》上。

Verkko从组装第一个无间隙人类基因组序列中成长起来,该序列于去年由端粒到端粒(T2T) 联盟完成。研究人员称,他们利用了在T2T项目中学到的知识,并使流程自动化。有了Verkko,他们现在只需按下一个按钮就能自动获得完整的基因组序列。
T2T联盟使用新的DNA测序技术和分析方法来生成和组装剩余的8%—10%的人类基因组序列。利用Verkko可在几天内完成任务;而当研究人员手动组装这些碎片时,这个庞大且技术精湛的团队需花费数年时间才能完成同样的任务。
Verkko首先将细小的细节组合在一起,然后将组装区域与更大、更不精确的部分进行比较。这些较大的部分作为一个框架来对更详细的区域进行排序。最终产品就是准确完整的基因组序列。
随着Verkko带来更完整的人类基因组序列,研究人员可更好地评估人类基因组多样性。目前,科学家们还缺乏对整个人类基因组许多部分多样性的了解,例如高度重复的DNA区域。
研究人员表示,Verkko还将加快生成常用物种的无缝基因组序列,例如小鼠、果蝇和斑马鱼,以提高它们对科学的实用性。
总编辑:张杰
值班副总编辑:邓晴风
责任编辑:江逸 蒋煜
编辑:杨雪霜
来源:科普中国、科技日报

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